Третий сезон «Индекса волшебства» начинается с того, что Камидзё Тоума возвращается к своей привычной жизни в Академии-сити после событий в Италии. Однако идиллия длится недолго: мир магии снова втягивает его в водоворот интриг. На этот раз конфликт разрастается до глобальных масштабов. Британская королевская семья оказывается на грани раскола: архиепископ Лора Стюарт плетет сложную сеть заговоров, а принцесса Карисса жаждет власти, используя запретный артефакт — Корону покойного короля. Параллельно в Академии-сити нарастает напряжение между научными фракциями. Тоума сталкивается с новыми врагами, такими как таинственный маг Кристиан Розенкрейц, который стремится уничтожить саму концепцию магии, и сталкивается с последствиями своих прошлых решений. Индекс, как хранитель 103 тысяч запрещенных книг, снова оказывается в центре внимания, но теперь её знания нужны не только для защиты, но и для предотвращения катастрофы, способной стереть грань между реальностями.
В то время как Тоума пытается защитить друзей и разобраться в хитросплетениях политических игр, его старый знакомый Стил Магнус и другие маги из Необходимой Церкви ввязываются в гражданскую войну в Британии. Каждый шаг героев ведет к неожиданным последствиям: раскрываются темные тайны прошлого, а союзники оказываются предателями. Особое место занимает противостояние с группой «Новый Свет», которая использует технологии и магию для достижения абсолютной власти. Тоуме приходится не только сражаться с могущественными противниками, но и принимать сложные моральные решения, цена которых — жизни тысяч людей. Финал сезона подводит к глобальному конфликту между наукой и магией, оставляя множество вопросов. Судьба Академии-сити и всего мира висит на волоске, а Тоума понимает, что его сила разрушать иллюзии может стать как спасением, так и проклятием для всех, кто ему дорог.
