Второй сезон «Амантю!» начинается ровно с того места, где закончился первый: Хиро, Такэру и Сюнсукэ наконец-то признались друг другу в чувствах, но их идиллия длится недолго. Внезапно в их жизни появляется загадочный парень по имени Рё, который утверждает, что является «смотрителем» за миром духов. Он сообщает, что связь между людьми и духами стала слишком сильной, и это нарушает хрупкое равновесие. Рё требует, чтобы Хиро прекратил видеться с Такэру и Сюнсукэ, иначе последствия будут катастрофическими — духи могут исчезнуть навсегда. Парни отказываются, но вскоре замечают, что их силы начинают ослабевать, а Такэру и Сюнсукэ периодически теряют сознание. Хиро в панике пытается найти способ сохранить их связь, но каждый шаг только ухудшает ситуацию. Вдобавок ко всему, Рё оказывается не просто смотрителем — он сам когда-то был человеком, влюбленным в духа, и его трагическая история становится предупреждением для троицы.
Пока Хиро мечется между желанием защитить любимых и страхом их потерять, Такэру и Сюнсукэ начинают вести себя странно. Они скрывают от Хиро, что чувствуют, как их сущность постепенно растворяется, и каждый раз, когда они используют свои силы, часть их памяти стирается. В отчаянной попытке спасти парней, Хиро решает обратиться к древнему духу, который, по слухам, может переписать правила мира духов. Но цена за это — полное забвение: если ритуал сработает, никто из них не вспомнит друг друга. В финале сезона Хиро стоит перед выбором: провести ритуал и спасти Такэру и Сюнсукэ от исчезновения, но навсегда потерять их из своей памяти, или отказаться и наблюдать, как они угасают на его глазах. В последней сцене он принимает решение, и мир окутывает белый свет, оставляя зрителя в неведении — удалось ли им сохранить любовь или всё стерлось без следа.
