В отдалённом будущем человечество распространилось по множеству планет, основывая колонии и исследуя глубины космоса. Однако этот прогресс был прерван, когда на земные поселения обрушились загадочные и свирепые виктимы, уничтожая всё на своём пути. Последней крепостью для выживших стала планета Сион, где появились пятеро огромных роботов, известных как Боги́ни. Эти уникальные машины не только отличались колоссальной мощью, но и обладали сознанием, способным устанавливать глубокую связь со своими пилотами и инженерами, становясь последним оплотом защиты цивилизации от захватчиков.
Готовить будущих пилотов Богинь взялся центр подготовки GOA, расположенный на орбитальной станции возле Сиона. Претендентам на это ответственное звание нужно было обладать не только редкой группой крови, но и экстрасенсорными способностями для слияния с роботом. В числе абитуриентов появился и новичок — Зеро, зарегистрированный под номером 88. Вчерашний школьник и не предполагал, что попадёт в водоворот опасных испытаний, где ему придётся разгадать тайны не только своего прошлого, но и истоки самих Богинь под натиском постоянных атак виктимов, стремящихся уничтожить последний форпост человечества.