Второй сезон «Переворотного суда» начинается с того, что Рюити Наруходо, уже успевший привыкнуть к хаосу неожиданных судебных баталий, сталкивается с делом, которое ставит под сомнение саму природу его дара. В прошлом сезоне он научился «переворачивать» реальность, доказывая невиновность подзащитных через абсурдные, но логически безупречные построения. Теперь же в суде появляется таинственный прокурор, чьи аргументы не просто опровергают доводы защиты, а буквально стирают их из памяти присутствующих. Каждое его слово заставляет свидетелей и присяжных забывать только что услышанные улики, превращая процесс в битву не за истину, а за само восприятие событий. Наруходо приходится разрабатывать новую тактику: он учится фиксировать факты не только в сознании, но и на физических носителях, используя старомодные блокноты и диктофоны, чтобы противостоять этой ментальной атаке. Параллельно раскрывается, что за кулисами судебной системы действует организация, манипулирующая реальностью через древние артефакты, и Наруходо оказывается втянут в конфликт, где на кону стоит не просто свобода одного человека, а сама возможность справедливого правосудия.
Во втором сезоне сюжет углубляется в личную историю главного героя. Выясняется, что его способность «переворота» — не случайный дар, а наследие, переданное от исчезнувшего отца, который когда-то был легендарным судьей, способным видеть истину сквозь любые иллюзии. Расследование приводит Наруходо в закрытый архив, где хранятся записи процессов, изменивших ход истории, но все они оказываются пустыми — их содержание стерто тем же прокурором-фантомом. В финальных эпизодах разворачивается суд над самим временем: Наруходо предстоит защищать человека, обвиненного в преступлении, которое еще не произошло, но уже зафиксировано в будущих хрониках. Используя парадоксы и временные петли, он доказывает, что предопределенность не отменяет свободы воли, а истина не может быть уничтожена, даже если ее забыли. Сезон заканчивается клиффхэнгером: Наруходо понимает, что его отец не умер, а заперт в бесконечном судебном заседании, где каждое решение отменяет предыдущее, и теперь главному герою предстоит найти способ вырвать его из этого цикла, не разрушив саму ткань реальности.